อาการฝีบิดที่ลำไส้ (amoebic colitis)
มีอาการระดับปานกลางถึงขั้นรุนแรง หรือบางคนไม่มีอาการแต่เป็นพาหะนำโรค ขึ้นอยู่กับจำนวนแผลที่เกิดจากอะมีบา ถ้าเป็นที่สำไส้ใหญ่ส่วนมากได้รับอันตรายเกิดเป็นแผลทำให้มีอาการปวดท้อง ท้องเดิน น้ำหนักลดลงอย่างรวดเร็ว ขาดน้ำ อาการนี้มักเกิดควบคู่กับอาการที่เกิดที่ตับ หรืออาการเนื่องจากมีลำไส้ทะลุ กดเจ็บที่ใต้ชายโครงขวา อุจจาระมีมูกเลือดปน
ถ้าผู้ป่วยรายใดมีอาการน้อยกว่า 1 เดือน จัดเป็นระยะเฉียบพลัน ถ้าอาการนานกว่า อาจมีอาการท้องผูก สลับกับท้องเดินเล็กน้อย จัดเป็นโรคระยะเรื้อรัง
ภาวะแทรกซ้อนจากแบคทีเรีย ที่ทำอันตรายต่อแผลบิดอะมีบาที่ลำไส้ใหญ่มีความสำคัญ โดนเฉพาะในรายที่ป่วยเรื้อรัง การให้ยาทำลายเชื้อแบคทีเรียและอะมีบาจะทำให้เกิดรอยแผล มีแผลเป็น แข็ง การบีบตัวของลำไส้อาาจะเสียไป หรือการทำงานของลำไส้ผิดปกติไป ทำให้เกิดอาการ postdysenteric syndrome
อาการฝีบิดที่ตับ (amoebic liver abscess)
เมื่อกลุ่มอะมีบาเจาะทะลุผนังลำไส้ใหญ่ผ่านไปตามเส้นเลือดไปสู่ตับ ตับจะโตเนื่องจากมีการทำลายเนื้อเยื่อตับโดยตัวอะมีบา หรือมีแบคทีเรียติดเชื้อ หรือผลจากสารพิษต่าง ๆ ระยะแรกเป็นระยะเฉียบพลัน ต่อมากลายเป็นฝีบิดอะมีบาในตับ การขยายตัวใหญ่ขึ้นของฝีบิดในตับเห็นได้โดยใช้ภาพถ่ายทางรังสีหลังจากฉีดสารทึบรังสีเข้าไป ส่วนมากผู้ป่วยจะเป็นที่ตับข้างขวา มีอาการปวดบริเวณชายโครงขวา อ่อนเพลีย น้ำหนักลดลง เนื่องจากการดูดซึมเอาของเสียจากแผลที่เป็นหนอง การทำงานของตับผิดปกติ ส่วนมากเป็นผู้ป่วยชาย
อาการฝีบิดที่สมอง (amoebic brain abscess)
การเป็นฝีบิดอะมีบาที่สมองเนื่องจากตัวอะมีบาจากแผลที่ลำไส้ใหญ่ล่องลอยไปตามกระแสเลือด ผู้ป่วยจะมีอาการแสดงอย่างรวดเร็ว เนื่องจากเนื้อสมองถูกทำลาย โดยเฉพาะส่วน cerebral hemisphere การตรวจวินิจฉัยทำได้ยาก นอกจากผู้ป่วยจะเสียชีวิตและถูกผ่าศพพิสูจน์ โดนจะมีอาการปรากฏในช่วง 7 - 10 วัน ก่อนเสียชีวิต
อาการฝีบิดที่อวัยวะภายในส่วนอื่นและที่ผิวหนัง (amoebiasis of others viscera and skin)
อาการฝีบิดอะมีบาที่อวัยวะภายในส่วนอื่นและที่ผิวหนัง ขึ้นอยู่ที่จะเกิดกับอวัยวะหรือเนื้อเยื่อชนิดใด แต่ที่เหมือนกันคือจะมีอาการเจ็บปวดบริเวณอวัยวะที่เป็น มีไข้มีเม็ดเลือดขาวมาชุมนุม หรือมีจำนวนเม็ดเลือดขาวเพิ่มขึ้นในกระแสเลือด ในรายที่เป็นที่ผิวหนัง ผิวหนังจะบวมนูน เป็นแผลเปื่อย ขอบแผลบวมนูนสีแดงคล้ำ ตรงกลางเป็นหนองและมีกลิ่นเหม็น