1.  ก่อนการเพาะเห็ดโรงเรือนต้องสะอาด เมื่อเก็บดอกเห็ดหมดแล้วจะต้องเก็บวัสดุทุกชิ้นออกให้หมด ทั้งบนชั้นเพาะและพื้นโรงเรือน ใช้น้ำล้างทำความสะอาด

2.  ต้องเปิดโรงเรือนทิ้งไว้ 4-7 วัน เพื่อให้โรงเรือนแห้งและก่อนจะเพาะเห็ดรุ่นต่อไปต้องฆ่าเชื้อต่าง ๆ ด้วยน้ำยาฆ่าเชื้อ โดยใช้หัวฉีดพ่นเป็นฝอยทั้งบนพื้นและบนชั้นเพาะ โดยเฉพาะบนชั้นต้องทำการฉีดพ่นให้ทั่วทุกซอกทุกมุม แล้วใช้ปูนขาว โรยให้ทั่วอีกครั้งหนึ่งทั้งบนพื้นและบนชั้น